La carrera política de Ántero Flores-Aráoz comenzó en el año 1986 cuando fue elegido regidor municipal por el Partido Popular Cristiano (PPC).
Más tarde en el periodo congresal de 1990-1995 ocuparía el cargo de diputado y formaría parte de la comisión que investigó al expresidente Alán García por enriquecimiento ilícito durante su primer mandato presidencial.
Luego sería congresista de la República por tres periodos consecutivos. Tras 20 años en el Partido Popular Cristiano, Flores- Aráoz luego de una fuerte discrepancia con Lourdes Flores decidió renunciar al partido.
Su más reciente participación en la política fue en el 2016 cuando postuló a la presidencia con el Partido Político Orden, en aquella campaña electoral uno d sus spots generó un sinfín de comentarios.
